SCR reaktorius turi fiksuoto sluoksnio formą, o katalizatorius dedamas į modulį. Katalizatoriaus sluoksnių skaičius reaktoriuje priklauso nuo reikalingo katalizatoriaus reakcijos paviršiaus ploto.
Įprastas išdėstymas yra dviejų ar trijų katalizatoriaus sluoksnių išdėstymas. Virš viršutinio katalizatoriaus sluoksnio yra rektifikacinis sluoksnis be katalizatoriaus, kuris naudojamas užtikrinti, kad išmetamosios dujos, patekusios į katalizatoriaus sluoksnį, pasiskirstytų tolygiai. Paprastai po trečiuoju katalizatoriaus sluoksniu yra laisvos vietos ketvirtam katalizatoriaus sluoksniui pridėti, kai katalizatoriaus aktyvumas mažėja. Tarp reaktoriaus katalizatoriaus sluoksnių įrengiamas suodžių pūtimo įrenginys, o suodžių pūtimo ir šlavimo laikas yra 30–120 minučių, 1–2 kartus per savaitę.
Jei reikia, reaktoriaus viduje reikia reguliariai valyti. Po reaktoriumi yra pelenų bunkeris, kuris yra prijungtas prie elektrinės pelenų išleidimo sistemos reguliariam pelenų išleidimui.
